主要从事数量遗传建模和发展统计分析方法的理论研究，研究复杂性状与生物信息分析的方法，研制开发数量遗传与生物信息分析的计算机软件。

遗传模型和分析方法主要有：

1. 提出了包括QTL加性、显性、上位性主效应及其与环境互作的基因定位遗传模型；
2. 提出了可分析数量性状主基因和微效多基因遗传效应的二倍体动植物遗传模型和作物种子遗传模型；
3. 提出了可以分析啤酒大麦麦芽性状的二倍体胚和三倍体胚乳遗传效应及其与环境互作效应的遗传模型；
4. 提出了可以提高检测功效和降低假阳/阴性率的cDNA微阵列基因表达谱分析方法；
5. 提出了可以包括宿主和寄主二个基因组之间基因相互作用的QTL定位遗传模型。

统计分析方法主要有：

1. 提出了基于混合线性模型的复合区间作图方法，能有效定位QTL并分析其上位性效应及QTL与环境互作效应，突破了国际上通用的QTL基因定位方法不能有效分析上位性及QTL与环境互作的局限性；
2. 提出了估算基于混合线性模型的成对性状之间各项遗传协方差分量的MINQUE算法；
3. 提出了以较小的样本保留原群体遗传变异性的种质资源核心库的构建方法；
4. 提出了基于混合线性模型和MCMC方法的基因定位统计方法并开发了计算机分析软件QTLNetwork。

最后编辑: 2023年2月1日