原始数据格式

原始数据格式如同 Sample 文件夹中的 QTLData.txt 所示。对于一个所有列都填满的数据来说,为首的三列分别是环境,区组,和基因型。这三列需要按顺序排列。接下来的列分别是需要分析的性状数据,最后一列是”;“,作为结束符。对于环境列,最大的数据就是等于所具有的环境类型数;对于区组列,最大的数据等于环境中所具有的最大区组数。环境和区组列都是可以缺失的。对于一个不完全填满的数据文件来说,如果环境列缺失,那么区组列自动成为首列。当环境或者区组有一列是缺失时,基因型列自动成为第二列;当环境和区组列都缺失时,自动成为第一列。用一个电子表格软件很容易建立符合标准的数据格式。

1 建立一个新的数据表格。
2 按顺序,在标题行里依次填写“环境”,“区组”,“基因型”,以及需要分析的性状的名称,别忘了在填写完毕后加上一分号列作为结束。
3 根据实际数据填写表格。
4 填写完毕后,删除所有空白的列。
这样你就已经建立一个符合标准的数据了。
缺失数据用点号表示(".") 。

 
 
 
连锁图谱的系数设置框将在选定后自动弹出
1.是否包含环境效应
选择“ 否 ”表示原始数据不包含环境效应,选择“ 是 ”表示包 含环境效应。
2.是否包含区组效应
当区组效应选项为否, 基因型 将是默认的Jackknife选项。当区组效应选项为是,基因型与 区组 都是可选的。
3.GE VAR
如果选择这个选项,程序讲预测基因效应。结果文件将自动保存位 filename.pre .
4. Step型条件
如果选择这个选项,还可以进一步选择步长,步长可以从1到9。程序将构建 顺序条件分析 ( t |t -1 ) 型的数据。结果文件将自动保存为 filename.cos 。如果这个选项未选定,那么步长也将是不可选的。
5. Final型条件
如果选择这个选项,程序将构建 顺序条件分析 ( f |t) 型的数据。结果文件将自动保存为 filename.cof 。
6.Run
运行 已经设定系数的方法和模型 。
7.Cancel
退出。
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