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QGAStation有以下几个特点：可以分析农艺性状，动物性状，种子性状，和发育性状等的复杂遗传模型；可以分析非平衡数据；使用jackknife的方法测试各个参数的显著性；分析结果输出文件中列出了一些重要的参考文献。本软件中的模型和公式可以参考遗传模型分析方法(朱军著，1997，中国农业出版社，北京）或 Handbook of Formulas and Software Plant Geneticists and Breeders (Manjit S. Kang编，2003，Food Products Press, New York)或朱军上的有关论文。
QGAStation 2.0 支持GPU与CPU混合计算。