樊龙江

教授、博导

浙江大学

作物科学研究所

生物信息学研究所

IBM生物计算实验室

   

联系方式:

电话:0571-86971730(办)、13738010968(手机)

实验室:http://ibi.zju.edu.cn/bioinplant/

E-mail: fanlj@zju.edu.cn

学历

1992-1996年:浙江农业大学作物遗传育种,硕士,导师:颜启传教授

1996-1999年:浙江大学生态学(生态系统模型与模拟方向),博士,导师:胡秉民教授

从事研究领域与授课

(1)主要研究领域:进化基因组学、作物家养化的分子遗传学基础及其生物信息学研究方法

(2)目前研究兴趣与课题:水稻等禾本科植物基因组及其重要基因家族分析与驯化的进化机制;禾本科植物比较基因组学;生物信息学新方法研究。

(3)授课:《生物信息学》(研究生和本科生)、《生物序列模型分析方法》(本科生)、《遗传学》(本科生)、《生物统计学》(本科生)

目前主持的主要研究课题:

水稻与竹类植物的比较基因组学研究,教育部新世纪人才支持计划,2006-2008

水稻基因组特有基因的分析,国家自然科学基金项目,#30471067,2005-2007

主要农作物骨干亲本遗传构成和利用效应的基础研究,973项目,2006-2010

水稻品质等重要农艺性状的功能基因组研究,863项目,2006-2010

科研成果、学术称号:

教育部新世纪人才支持计划获得者(2005)
浙江省“151人才工程”入选第2层次(2004)
浙江省科技进步三等奖(第3位)(2001)
农业部科技进步三等奖(第2位)(1999)
国家教委科技进步二等奖(第2位)(1991)

国际合作与活动:

2007年3-5月:澳大利亚CSIRO植物研究所
2005年9-11月:德国DAAD访问学者
2005年6月:台湾大学植物研究所合作研究
2002年4-9月:德国校际交流项目访问学者

近年来主要研究论文:

Xingyi Guo, Yu Wang, Peter D. Keightley and Longjiang Fan*.  Patterns of selective constraints in noncoding DNA of rice. BMC Evolutionary Biology, In press

Xingyi Guo, Songlin Ruan, Weiming Hu, Daguang Cai, Longjiang Fan*. Chloroplast DNA insertions into the nuclear genome of rice: the genes, sites and ages of insertion involved. Functional and Integrative Genomics, In press

Sheng Wang, Qianhao Zhu, Xingyi Guo, Yijie Gui, Jiandong Bao, Chris Helliwell, Longjiang Fan*. Molecular evolution and selection of a gene encoding two tandem microRNAs in rice. FEBS Letters 581:4789-4793. [PDF]

Guo X, Bao J, Fan L*. 2007. Evidence of selectively driven codon usage in rice: implications for GC content evolution of Gramineae Genes. FEBS Letters 581:1015-1021.[PDF]

Gui Y, Wang S, Quan L, Zhou C, Long S, Zheng H, Jin L, Zhang X, Ma N and Fan L*. 2007, Genome size and sequence composition of moso bamboo: A comparative study. Science in China 50(5): 1-6.[PDF]

Guo X, Xu G, Zhang Y, Wen X, Hu W, Fan L*. 2006. Incongruent evolution of chromosome size in rice. Genetics and Molecular Research 5(2): 373-389.[PDF]

Schulte D, Cai D, Keline M, Fan L, Wang S, Jung C. 2006. Complete physical map of a wild beet (Beta procumbens) translocation in sugar beet. Molecular Genetics and Genomics 275: 504-511. [PDF]

Zhang Y, Xu G, Guo X and Fan L*. 2005. Two ancient rounds of polyploidy in rice genome. J Zhejiang Uni SCIENCE 6B:87-90. [PDF]

Tian YY, Fan LJ (并列第一作者), Thurau T, Jung C and Cai DG. 2004. The absence of TIR-type resistance gene analogues in sugar beet (Beta vulgaris L.) genome. Journal Molecular Evolution 58:40-53. [PDF]

*完整论文目录见实验室主页:http://ibi.zju.edu.cn/bioinplant/

出版著作:

(1) 樊龙江. 2005. 生物信息学札记(第2版)(网络教材) http:ibi.zju.edu.cn/bioinplant/

(2) 樊龙江,周雪平. 2001. 转基因作物——争论与事实. 北京:中国农业出版社

(3) 周雪平,樊龙江,舒庆尧. 2001. 破译生命密码——基因工程.杭州:浙江大学出版社