祝贺!本团队6位研究生顺利完成论文答辩

2026年6月2日,在西区农科创大楼生物信息与大数据技术中心A205,本团队博士生黄毓杰、程海军、Kehinde Babatunde Olayink和硕士生张诗雨、胡煜蓉、赵盼完成毕业答辩。来自湖南省农科院王立峰研究员、山东省农科院李健研究员、上海师范大学邱杰教授和本校徐海明教授、陈家悦研究员和叶楚玉教授作为评委参加了博士生论文答辩,中科荃银公司方玉研究员、上海市农科院谢玲娟副研究员和本校陈露研究员、褚琴洁研究员作为评委参加了硕士生论文答辩,三位指导导师樊龙江教授(三位博士生和硕士生张诗雨)、叶楚玉教授(赵盼)和褚琴洁研究员(胡煜蓉)均参加了答辩会。


博士生黄毓杰以“禾本科马唐属基因组演化与遗传渗入研究”为论文答辩主题,围绕禾本科马唐属基因组演化与遗传渗入开展研究,构建了马唐及其二四倍体祖先参考基因组,揭示多倍化中基因家族扩张与亚基因组优势;绘制首个马唐属全基因组遗传变异图谱,解析其演化历史与环境适应性基因组基础;通过抗性实验鉴定除草剂抗性候选基因,明确遗传渗入参与抗性形成,开发远缘渗入鉴定流程,为小宗作物改良和恶性杂草防控提供理论与资源支撑。


博士生程海军以“禾本科核型演化及其黍族保守核型物种研究”为论文答辩主题,聚焦禾本科核型演化及黍族保守核型,基于 29 个高质量基因组重建禾本科核心类群祖先核型,解析核型演化轨迹,鉴定出 58 个亚科特异性染色体重排事件;完成异源六倍体野黍基因组组装注释,揭示保守核型物种多倍化下的基因组演化特征,为植物祖先核型研究和作物遗传改良提供方法与理论参考。


博士生Kehinde Babatunde Olayink以“非洲杂草稻起源及其环境适应性基因组学研究 ”为论文答辩主题,开展非洲杂草稻基因组与适应性研究,整合全球水稻基因组数据,首次系统解析尼日利亚杂草稻的三条独立起源路径,证实非洲栽培稻为其重要祖先;解析环境适应性遗传基础,揭示跨物种基因交流的作用及杂草稻趋同与分化适应机制,为非洲杂草稻防控和水稻种质利用提供理论依据。


硕士生张诗雨以“植物基因组数据分析及其平台构建”为论文答辩主题,收集整理2000-2025年全球植物核基因组数据,构建涵盖6027个基因组、2558个物种的数据集,揭示植物基因组学研究方法发展规律;搭建N3植物基因组综合数据库,建立基因组质量评估方法,构建五大粮油作物高质量基因组数据集,填补公共平台整合分析空白。


硕士生胡煜蓉以“基于Hi-C的植物三维基因组比较分析及稻稗互作的初步探究”为论文答辩主题,以稻属为对象,整合多组学数据构建物种特异性参考转录组和跨物种泛转录组,揭示核心基因与物种特异性基因的功能差异;构建稻属跨物种共表达网络,阐明编码与非编码RNA的调控作用,开发泛转录组数据库与可视化平台,实现多组学数据整合共享。


硕士生赵盼以“稻属泛转录组构建及调控网络研究”为论文答辩主题,以水稻、拟南芥为模式,构建植物三维基因组Hi-C数据分析流程,分析三维基因组结构的时空差异;以稻稗互作为案例,测定不同种植条件下的Hi-C数据,初步探究种间互作对植物三维基因组的影响。


时光荏苒如白驹过隙,往事依稀若素月流空。转眼间几位毕业生的求学生涯已接近尾声。在这几年中,他们有学习室中的挑灯夜读,冥思苦想,用实践夯实地基;也有文章中的字斟句酌,吹尽缺漏,成就佳作。长路漫漫,青春未央,愿这些年的所学所知,可以让他们在未来乘风而起,扶摇直上九万里!




(周芮遥)