樊龙江教授应邀首届植物单细胞生物学国际研讨会上进行报告
2021年4月17-18日由首届植物单细胞生物学国际研讨会(The 1st International Symposium on Plant Single Cell Biology)在华中农大举行。来自国内外19位专家(国外5位和国内14位)分别进行了报告。樊龙江教授应邀做了“Bioinformatics issues for plant single-cell RNA analysis”的报告。中科院遗传所焦雨铃、中国农科院谷晓峰、南方大学翟继先、华大生命研究院刘欢等分析进行了报告。
樊龙江教授就目前植物单细胞RNA分析中涉及的质控(细胞器DNA比例)、标记基因(细胞类型注释)和细胞测序数量等问题汇报了本实验室研究结果,报告引起广泛关注和讨论。报告中重点介绍了本实验室刚刚建立的植物单细胞RNA分析数据库PlantscRNAdb (http://ibi.zju.edu.cn/plantscrnadb/)。该数据库为植物单细胞类型注释提供了重要的标记基因信息。
会议最后安排了一个“圆桌讨论”环节,由武汉大学孙蒙祥教授主持,就当前植物单细胞RNA研究的难点、趋势和国内组织等进行了讨论。