 |
| 种子性状分析模型 |
| ADM（3n） Model |
| 三倍体胚乳加性－显性－母体效应遗传模型 (A, D, M, AE, DE, ME) |
| GoGe Model |
| 胚芽－胚乳效应遗传模型 (Ao, Do, Ae, De, AoE, DoE, AeE, DeE) |
| GoCGm（2n） Model |
| 二倍体种子胚－细胞质－母体效应遗传模型 (A, D, C, Am, Dm, AE, DE, CE, AmE, DmE) |
| GoCGm（3n） Model |
| 三倍体胚乳－细胞质－母体效应遗传模型 (A, D, C, Am, Dm, AE, DE, CE, AmE, DmE) |
| GoGeGm Model |
| 胚－胚乳－母体效应遗传模型 (Ao, Do, Ae, De, Am, Dm, AoE, DoE, AeE, DeE, AmE, DmE) |
| GoGeCGm Model |
| 胚－胚乳－细胞质－母体效应遗传模型 (Ao, Do, Ae, De, C, Am, Dm, AoE, DoE, AeE, DeE, CE, AmE, DmE) |
| 原始数据格式 |
原始数据格式如同Sample文件夹中的CotSeed.txt和CotSeedBoll.txt所示。前五列 是固定不变的格式，依次是：环境（例如 年份或者地点），母本，父本，世代，和区组。世代代码0表示双亲，1表示F1，2表示F2，3表示BC1(F1×Pi)， 4表示BC2(F1×Pj)，5表示RBC1(Pi×F1)， 6表示RBC2(Pj×F1)，7表示F3，8表示F4，9表示BC1×F2，10表示BC2×F2，11表示RBC1×F2，12表示RBC2×F2。 固定列的其他四列最小值都是1，相应最大值分别表示环境的数目，在第二列跟第三列表示亲本数目，在第五列表示相同环境下的区组数目。各列应按数值从小至大顺序依次排列 。缺失数据用点号表示(".")。 |
| 种子性状分析方法中的所有模型具有相同的系数设置框，它将在您选定一个种子模型后自动弹出。 |
 |
| 1.是否包括区组效应 |
| 选择“否”表示原始数据不包括区组 效应（这个时候，原始数据区组所在列编号都是1）；或者在区组存在的情况下忽略区组效应，而将区组当试验的重复看待。选择“是”表示包括区组效应 ，而且试验数据中的确有区组存在（这个时候，原始数据区组所在列编号应该是1，2，3……）。 |
| 2.Jackknife类型 |
| 当区组效应选项为否，基因型将是默认的Jackknife类型选项。当区组效应选项为是，基因型与区组都是可选的。 如果Jackknife类型选项为区组，则Jackknife抽样数目将默认为1。 |
| 3.Jackknife抽样数目 |
| Jackknife 重复抽样单位数目可以是1 至 9。 如果试验存在重复，那么Jackknife的抽样数目建议是重复数的整数倍。 |
| 4.语言 |
| 分析结果输出文件所使用的语言，可以选用中文或者英文。 |
| 5.随机效应预测方法 |
| AUP (adujusted unbiased prediction) 或者 LUP (linear unbiased prediction) 都可以预测随机效应值。 |
| 6.是否做条件分析 |
| 对性状观测值做后项(第t项)对前项(第t-n项)的顺序条件分析(t|t-n)，可选择“Step”类型 ；如果想分析最终性状与此前任一时刻的条件分析(f|t)，可选择“Final”类型。当条件类型为Final时，步长值将为默认值。条件类型为Step时，步长值可以 根据数据调整。 |
| 7.条件类型 |
| 对性状观测值做后项(第t项)对前项(第t-n项)的顺序条件分析(t|t-n)时，可选择“Step”类型 ；如果想分析最终性状与此前任一时刻的条件分析(f|t)，可选择“Final”类型。当条件类型为Final时，步长值将为默认值。条件类型为Step时，步长值可以 根据数据调整。 |
| 8.步长 |
| 步长值可以从1至9，应该根据原始数据的情况以及所关心的分析对象选择适当的值 ，但是步长值不可大于等于总性状数。当条件类型为Final时，步长为默认值，不需要设定，将依次对性状最后时期在给定前面任一时期的条件分析。 |
| 9.是否估算种子与母体的协方差 |
| 选择是，将估算种子与母体的协方差；选择否，将不估算。只有在2nGoCGm和3nGoCGm模型中，这个选项可用。 |
| 10.种子性状于农艺性状关系 |
| 对于2nGoCGm 和 3nGoCGm 模型, 此选项可用, 选择此项, 将估算母体性状与种子性状相关性。 |
| 11.种子性状数 |
| 原始数据文件中, 种子性状的数目(种子性状必须排在农艺性状前)。 |
| 12.Var |
| 当选择此选项，程序将估计方差分量并且预测随机效应。结果将自动保存为filename.var。 |
| 13.Het |
| 如果选择这个选项，程序将预测杂种优势。结果将自动保存为filename.pre. 对于A，ADM，ADMP，和ADGE模型，这个选项不可选。 |
| 14.Cov |
| 如果选择这个选项，程序将估计协方差分量和相关系数，但是此选需要首先选择Var和（或）Het选项。结果将自动保存为filename.cov。 |
| 15.运行 |
| 运行已经设定系数的方法和模型。 |
| 16.取消 |
| 退出。 |